L'organisation des concours et examens professionnels prévus par les statuts particuliers directement ou par convention avec d'autres Centres de gestion ou collectivités non affiliées. Le Centre de gestion assure également la prise en charge des fonctionnaires de catégorie C et B momentanément privés d'emplois.
La publicité des vacances d'emploi (bourse à l'emploi) pour l'ensemble des collectivités affiliées ou non, ainsi que la publicité des listes d'aptitude.
Pour l'ensemble des agents de catégories A, B et C relevant des collectivités et établissements publics affiliés, le Centre de gestion organise le fonctionnement des commissions administratives paritaires, des conseils de discipline et le suivi des carrières des agents des collectivités.
Il assure également le secrétariat du comité technique paritaire créé pour les collectivités de moins de 50 agents.
Il relaye au niveau départemental certains organismes tels la Caisse Nationale de Retraite des Agents des Collectivités Locales (C.N.R.A.C.L.).
Dans le cadre de la gestion prévisionnelle des emplois et des compétences (G.P.E.E.C.), il assure enfin une mission de réflexion sur les recrutements futurs en collaboration avec les collectivités et les établissements publics non affiliés.
Le Centre de gestion assure un service prévention des risques professionnels, qui a pour mission d’aider les collectivités à prévenir, maîtriser et réduire les risques liés aux activités professionnelles. Il propose des audits sécurité aux collectivités qui en expriment le besoin.
Outre ces missions obligatoires, le Centre de gestion du Haut-Rhin propose un certain nombre de missions facultatives.